Secara administratif, IMAVI bukanlah penyelenggara program-program pendidikan umum yang disajikan. Program Studi Filsafat konsentrasi Filsafat Keilahian adalah program studi yang diselenggarakan oleh Fakultas Filsafat UKWMS. Sedangkan, Program Studi Magister Manajemen konsentrasi Kepemimpinan Pastoral adalah program studi yang diselenggarakan oleh Fakultas Bisnis UKWMS.
Pada dasarnya, IMAVI dalam kerja sama dengan Seminari Tinggi Providentia Dei berperan sebagai penanggung jawab studi para calon imam Seminari Tinggi yang sedang menempuh pendidikan pada kedua program studi di atas.
Selain itu, IMAVI turut berperan dalam proses penyajian program-program studi ini baik dalam hal perencanaan, penyelenggaraan perkuliahan sebagian mata kuliah, dan pengadaan dosen pengajar, khususnya berkenaan dengan konsentrasi filsafat keilahian dan peminatan di bidang kepemimpinan pastoral.
Pada 2 tahun pertama, diberikan materi filsafat sebagai persiapan untuk studi teologi. Lalu, 2 tahun berikutnya diberikan materi teologi atau filsafat keilahian. Materi-materi yang diberikan pada program studi ini pada dasarnya merupakan materi-materi yang juga diberikan untuk program studi pendidikan dasar khususnya pada 7 semester pertama.
Materi program studi ini meliputi mata kuliah manajemen yang berlandaskan pemahaman tentang pengelolaan dan pengembangan suatu organisasi bagi karya pastoral dalam Gereja.
Seperti halnya program studi Teologi Dasar dan program studi profesi kepemimpinan pastoral IMAVI, kurikulum disusun dengan kepekaan terhadap konteks sosial kemasyarakatan dan berorientasi untuk menanggapi kebutuhan Gereja di Indonesia.